细粒棘球绦虫泛素结合酶基因家族的生物信息学及表达分析
杜小迪，侯巍，苏中华，马青梅，何雪，华瑞其，阳爱国，杨光友
1. 四川农业大学动物医学院 2. 四川省动物疫病预防控制中心 3. 西藏自治区动物疫病预防控制中心 4. 青海省海北州海晏县畜牧兽医站
摘要：本研究对细粒棘球绦虫泛素结合酶(Eg E2s)基因家族进行鉴定、生物信息学分析以及检测其在不同发育阶段的转录水平,为其功能研究和构建优势抗原表位疫苗奠定基础。本研究基于数据库中细粒棘球绦虫基因组学信息,对Eg E2s基因家族进行 T-A 克隆、生物信息学分析以及采用q RT-PCR法检测了这些基因在原头蚴(Proto-scolex,PSCs)和28日龄童虫中的转录水平。结果成功克隆并测序19个 Eg E2s基因,更正了两个原序列有误的Eg E2s,分别为Eg E2L3(登录号:MZ277618);Eg E2J1(登录号:MZ277619)。三级结构和保守基序预测结果表明Eg E2s高度保守。q RT-PCR结果显示,Eg E2s的转录水平在 PSCs和28日龄童虫中存在差异,其中 Eg E2A(P<0.001)、Eg E2J1(P<0.01)在 PSCs阶段高表达。B 细胞抗原表位预测表明 Eg E2N 的 139-157区域位于 Eg E2s保守基序外。同时,T 细胞抗原表位预测表明Eg E2N 与人和犬 MHC Ⅰ类分子各有两个强结合位点,且有一个共同的抗原表位位点104-113。综上,Eg E2A 和 Eg E2J1可能在 PSCs的生长发育中 起 重 要 作 用。Eg E2N 的 139-157和104-113区域可能是药物研究和疫苗开发的靶序列。
关键词：细粒棘球绦虫;泛素结合酶基因家族;生物信息学;转录水平分析
基金资助：四川省科技厅重点研发项目(2022YFN0013)；
引用：杜小迪,侯巍,苏中华等.细粒棘球绦虫泛素结合酶基因家族的生物信息学及表达分析[J].畜牧兽医学报,2023,54(06):2605-2618.
